Program Studi (PS) Agroteknologi terbentuk berdasarkan peleburan dari dua PS yang telah ada di  Fakultas Pertanian Universitas Tanjungpura yaitu PS Agronomi dan PS Ilmu Tanah. PS Agroteknologi berdiri berdasarkan Surat Keputusan Direktorat Jenderal Pendidikan Tinggi Departemen Pendidikan  Nasional      No. 54/DIKTI/KEP/2007 pada Tanggal 02-04-2007.   PS Agroteknologi baru menerima mahasiswa pada Tahun  Akademik 2009-2010. Penyelenggaraan PS Agroteknologi  ditetapkan  berdasarkan  Surat Keputusan  Rektor Untan No.4340/D/T/K-N/2010  yang merupakan Perpanjangan Ijin PS Agroteknologi