Program Studi Sistem Informasi FMIPA Untan berdiri pada tanggal 19 Mei 2014 berdasarkan Keputusan Menteri Nomor: 442/E.E2/DT/2014. Prodi Sistem Informasi dibangun atas 3 bidang yaitu Ilmu Komputer, Manajemen, dan Bisnis, sehingga mampu memberikan solusi terkait sistem informasi yang sesuai dengan kebutuhan organisasi. Sistem pendidikan pada Prodi Sistem Informasi mengedepankan penerapan teknologi terbaru yang berelasi dengan kebutuhan dunia kerja. Lulusan Prodi Sistem Informasi difokuskan menjadi akademisi, konsultan, praktisi, dan teknopreneur dalam bidang sistem dan teknologi informasi.

Kurikulum Program Studi Sistem Informasi saat ini disesuaikan dengan Peraturan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia Nomor 3 Tahun 2020 tentang Standar Nasional Pendidikan Tinggi yang memuat kebijakan mengenai Merdeka Belajar Kampus Merdeka (MBKM), dengan kurikulum yang mereferensi dari standar IS Computing Curricula yang dikeluarkan oleh ACM tahun 2020 serta kerangka kerja KKNI APTIKOM tahun 2019. Muatan kurikulum Program Studi Sistem Informasi sekarang terdiri dari kurikulum teori 149 SKS (97%) dan kurikulum praktek 5 SKS (3%). Adapun untuk menyelesaikan program sarjana di Program Studi Sistem Informasi wajib menyelesaikan minimal 144 SKS.

Dalam melaksanakan proses pembelajaran Program Studi Sistem Informasi menggunakan metode Student Centered Learning, Case Based Learning, dan Project Based Learning. Proses pembelajaran yang diterapkan mengarahkan mahasiswa untuk lebih aktif dalam mencapai hasil pembelajaran. Hal ini diterapkan dalam berbagai macam diskusi, tugas kelompok, pemecahan masalah atas studi kasus, penyelesaian proyek, maupun penyelenggaraan seminar mahasiswa, termasuk pula kemampuan soft skills, yakni kemampuan berkomunikasi, team work, menulis karya ilmiah, berfikir kreatif dan inovatif serta memiliki etika profesi